Tesis

Gambaran Disbiosis Mikrobioma Nasofaring dan Disfungsi Epitel Hidung pada Pasien Komorbiditas Insomnia pada Henti Napas Saat Tidur (COMISA) Dewasa Muda di Indonesia = Nasopharyngeal Microbiome Dysbiosis and Nasal Epithelial Dysfunction in Young Adult Patients with Comorbid Insomnia and Obstructive Sleep Apnea (COMISA) in Indonesia.

Latar belakang: COMISA merupakan kondisi gangguan tidur yang kompleks dengan beban morbiditas lebih tinggi dibandingkan HNST atau insomnia saja. Mekanisme biologis yang mendasari COMISA, khususnya peran disbiosis mikrobioma nasofaring dan disfungsi pertahanan epitel hidung, belum banyak diteliti, terutama pada populasi dewasa muda. Mengingat peran mikrobioma dan integritas epitel dalam regulasi inflamasi serta respons imun saluran napas atas, pemahaman terhadap kedua aspek ini penting untuk menjelaskan fenomena klinis COMISA. Tujuan: Melihat karakteristik dan hubungan disbiosis mikrobioma nasofaring serta disfungsi pertahanan epitel mukosa hidung pada pasien komorbiditas insomnia dan henti napas saat tidur (COMISA) dewasa muda di Indonesia. Metode: Studi potong lintang analitik observasional dilakukan di Poli THT Rinologi RSCM periode Agustus–Oktober 2025. Dilakukan pemeriksaan mikrobioma nasofaring, pengukuran biomarker epitel hidung, penilaian gejala menggunakan kuesioner NOSE, ESS, STOP-BANG, ISI, pemeriksaan polisomnografi, serta evaluasi pola kolaps saluran napas dengan DISE. Hasil: Penelitian ini menunjukkan bahwa keanekaragaman alfa tidak berbeda bermakna antara COMISA dan kontrol, namun beta diversity memperlihatkan perbedaan komposisi mikrobioma antar kelompok. Indeks disbiosis meningkat signifikan pada COMISA, meskipun korelasi antar takson dengan parameter klinis, PSG, dan DISE tidak menunjukkan pola yang konsisten. Analisis KEGG memperlihatkan kecenderungan peningkatan jalur metabolik terkait inflamasi, dan penurunan jalur GABA. Kadar laktoferin dan beta-defensin meningkat pada pasien COMISA, dengan rerata yang lebih tinggi pada kelompok UARS dibandingkan kelompok kontrol, namun mengalami penurunan pada kelompok HNST ringan. Kesimpulan: Penelitian ini mengidentifikasi adanya disbiosis mikrobioma nasofaring pada COMISA dewasa muda, ditandai oleh meningkatnya indeks disbiosis dan pergeseran komposisi mikroba. Ketidakkonsistenan hubungan antar takson terhadap parameter klinis mengindikasikan bahwa gangguan mikrobioma pada COMISA lebih mencerminkan disfungsi sistemik dibanding perubahan pada bakteri tertentu. Selain itu, peningkatan kadar laktoferin dan beta defensin pada kelompok COMISA mengindikasikan adanya proses inflamasi mukosa yang sedang berlangsung, yang mencerminkan aktivasi pertahanan epitel hidung. Peningkatan kadar pada UARS diduga merupakan respons protektif kompensatorik terhadap stres oksidatif, sementara penurunan pada HNST ringan dapat mencerminkan deplesi mediator imunitas bawaan akibat stimulasi inflamasi kronik. Temuan ini menekankan pentingnya evaluasi lebih lanjut dengan jumlah sampel yang lebih besar untuk memahami peran mikrobioma dan ketahanan epitel dalam patofisiologi COMISA.
Kata Kunci: disbiosis mikrobioma, disfungsi epitel hidung, laktoferin, beta defensin, COMISA


Background: COMISA is a complex sleep disorder associated with a greater morbidity burden than either OSA or insomnia alone. The underlying biological mechanisms of COMISA, particularly the contribution of nasopharyngeal microbiome dysbiosis and nasal epithelial barrier dysfunction remain poorly understood, especially in young adults. Given the critical role of the microbiome and epithelial integrity in regulating inflammation and immune responses of the upper airway, understanding these components is essential for elucidating the clinical manifestations of COMISA. Objective: To characterize nasopharyngeal microbiome dysbiosis and nasal epithelial barrier dysfunction, and to evaluate their relationship with clinical symptoms, sleep parameters, and upper airway collapse patterns in young adult patients with COMISA in Indonesia. Methods: An analytical observational cross-sectional study was conducted at Rhinology Clinic RSCM from August to October 2025. Assessments included nasopharyngeal microbiome profiling measurement of nasal epithelial biomarkers, clinical evaluations using the NOSE, ESS, STOP-BANG, and ISI questionnaires, polysomnography, and DISE to assess airway collapse patterns. Results: Alpha diversity indices did not differ significantly between COMISA and control groups, whereas beta diversity demonstrated compositional separation of the microbiome. The dysbiosis index was significantly elevated in the COMISA group, although correlations between individual taxa and clinical, polysomnographic, or DISE parameters were inconsistent. KEGG pathway analysis suggested upregulation of metabolic pathways associated with inflammation, and reduced GABA pathway. Lactoferrin and beta defensin levels were elevated in COMISA, with higher mean levels in the UARS group compared with controls and a decline observed in the mild OSA group. Conclusion: This study identifies nasopharyngeal microbiome dysbiosis in young adults with COMISA, characterized by an elevated dysbiosis index and shifts in microbial composition. The inconsistent taxon-level correlations with clinical parameters suggest that microbiome disturbances in COMISA likely reflect broader systemic dysfunction rather than the influence of specific bacterial taxa. In addition, the elevated levels of lactoferrin and beta-defensin observed in the COMISA group indicate an ongoing mucosal inflammatory process, reflecting activation of the nasal epithelial defense mechanisms. The increased levels in UARS likely reflect a compensatory protective response aimed at counteracting oxidative stress, whereas the reduction in mild OSA may indicate depletion of innate immune mediators secondary to chronic stimulation. These findings underscore the need for larger studies to further elucidate the interplay between the microbiome, epithelial integrity, and the pathophysiology of COMISA.
Keywords: microbiome dysbiosis, nasal epithelium, lactoferrin, beta defensin, COMISA