Skripsi

Prediksi Penghambatan Senyawa dalam Mangifera foetida terhadap Jalur COX-2 pada Sel Kanker Payudara MDA-MB-231 dengan Pendekatan Kemoinformatik dan Molecular Docking = Prediction of Mangifera foetida Compounds as COX-2 Pathway Inhibitors in MDA-MB-231 Breast Cancer Cells Using Chemoinformatics and Molecular Docking Approaches.

Latar Belakang Kanker payudara merupakan kanker dengan prevalensi tertinggi di dunia, termasuk di Indonesia. Triple-negative breast cancer (TNBC), khususnya sel MDA-MB-231, adalah subtipe yang sangat agresif dan tidak responsif terhadap terapi hormon maupun HER2- targeted karena tidak mengekspresikan reseptor estrogen, progesteron, maupun HER2. Enzim Cyclooxygenase-2 (COX-2) dioverekspresikan pada sebagian besar kasus TNBC (hingga 81,4%) dan berperan dalam proliferasi, inflamasi, serta progresi kanker. Daun Mangifera foetida (macang) mengandung berbagai senyawa bioaktif dengan potensi antikanker, namun belum banyak dieksplorasi terhadap COX-2. Penelitian ini bertujuan mengevaluasi potensi senyawa aktif M. foetida sebagai inhibitor COX-2 pada sel MDAMB-231 secara in silico. Metode Penelitian dilakukan dengan dua pendekatan utama: (1) prediksi IC₅₀ menggunakan model QSAR berbasis machine learning di DataWarrior yang divalidasi secara statistik; dan (2) molecular docking menggunakan Molegro Virtual Docker (MVD) terhadap protein COX-2 (PDB ID: 5KIR). Rofecoxib digunakan sebagai kontrol positif sekaligus ligan native untuk validasi re-docking, dan hasil docking dievaluasi berdasarkan rerank score. Hasil Prediksi in silico menunjukkan lima senyawa, yaitu 2H-Chromene, Luteolin, Quercitrin, Daidzein, dan Naringenin, memiliki IC₅₀