Skripsi

Studi In Silico Senyawa Batang Bidara (Ziziphus nummularia) sebagai Inhibitor Selektif SGLT2 untuk Terapi Diabetes Mellitus Tipe 2 = Studi In Silico Senyawa Batang Bidara (Ziziphus nummularia) sebagai Inhibitor Selektif SGLT2 untuk Terapi Diabetes Mellitus Tipe 2.

Latar Belakang Diabetes mellitus (DM) merupakan salah satu penyebab utama kematian di Indonesia. Salah satu pengobatan DM Tipe 2 adalah inhibitor SGLT2. Saat ini, berbagai penelitian untuk mencari pengobatan alternatif DMT2 masih terus dikembangkan. Ziziphus nummularia merupakan tumbuhan yang dapat mengatasi berbagai penyakit, salah satunya adalah diabetes dengan menurunkan kadar gula darah. Penelitian ini memiliki tujuan untuk membuktikan hubungan antara efek antidiabetes pada senyawa dalam Ziziphus nummularia dengan aktivitas inhibitor selektif SGLT2 secara in silico menggunakan prediksi nilai IC50 dan molecular docking. Metode Penelitian analitik observasional menggunakan metode prediksi nilai IC50 dengan DataWarrior dan molecular docking dengan Molegro Virtual Docker (MVD). Hasil Tiga senyawa dalam Ziziphus nummularia dengan potensi inhibitor SGLT2 terbaik adalah nummularine B (IC50 10,628 µM; LELP 7,53), nummularine P (IC50 8,01 µM; LELP 5,038), dan mauritine F (IC50 9,0935 µM; LELP 7,5). Molecular docking dengan protein SGLT2 menunjukkan bahwa 2 dari 3 senyawa tersebut memiliki Rerank Score negatif atau ikatan yang kuat, yaitu nummularine B (-101,616 J/mol), dan mauritine F (- 58,368 J/mol). Selanjutnya, molecular docking dengan protein SGLT1 menunjukkan ikatan yang buruk terhadap mauritine F (27,265 J/mol). Kesimpulan Prediksi nilai IC50 dan molecular docking menunjukkan potensi aktivitas inhibitorik SGLT2 yang baik pada senyawa Ziziphus nummularia, di antaranya adalah nummularine B, nummularine P, dan mauritine F. Dari 3 senyawa tersebut, mauritine F memiliki selektivitas tertinggi terhadap SGLT2 dan diharapkan memiliki efek samping minimal sebagai inhibitor selektif SGLT2.
Kata Kunci: Inhibitor SGLT2, Diabetes mellitus tipe 2, Ziziphus nummularia, In silico, IC50, Molecular docking


Introduction Diabetes mellitus is one of the leading causes of death in Indonesia. One treatment option for Type 2 DM is SGLT2 inhibitors. Currently, various studies are being conducted to find alternative treatments for T2DM. Ziziphus nummularia is a plant species known to treat diabetes by lowering blood glucose levels. This study aims to demonstrate the relationship between the antidiabetic effects of compounds in Ziziphus nummularia and their selective SGLT2 inhibitor activity through in silico analysis, using IC50 value prediction and molecular docking. Method This research is an observational analytical study using IC50 value prediction with DataWarrior and molecular docking with Molegro Virtual Docker (MVD). Results Three compounds in Ziziphus nummularia with the best SGLT2 inhibitory potential are nummularine B (IC50 10.628 µM; LELP 7.53), nummularine P (IC50 8.01 µM; LELP 5.038), and mauritine F (IC50 9.0935 µM; LELP 7.5). Molecular docking with the SGLT2 protein reveals that 2 of these 3 compounds have negative Rerank Scores, indicating strong binding, namely nummularine B (-101.616 J/mol) and mauritine F (- 58.368 J/mol). Further molecular docking with the SGLT1 protein showed poor binding with mauritine F (27.265 J/mol). Conclusion The IC50 value prediction and molecular docking demonstrated significant SGLT2 inhibitory activity in compounds from Ziziphus nummularia, including nummularine B, nummularine P, and mauritine F. Mauritine F exhibited the highest selectivity towards SGLT2, which is expected to result in minimal side effects when used as a selective SGLT2 inhibitor.
Keywords: SGLT2 inhibitor, Type 2 diabetes mellitus, Ziziphus nummularia, In silico, IC50, Molecular docking