Tesis

Analisis Single Nucleotide Polymorphism FOXO3 rs2802292 dan Kaitannya dengan Ekspresi Senescence-associated Secretory Phenotype pada Lansia di POSBINDU Jakarta Selatan = Analysis of rs2802292 FOXO3 Single Nucleotide Polymorphism and its Correlation with the Expression of Senescence-associated Secretory Phenotype in Elderly in POSBINDU South Jakarta.

Forkhead Box O3 (FOXO3) adalah faktor transkripsi yang meregulasi ketahanan terhadap stres, metabolisme, siklus sel, dan apoptosis. Beberapa penelitian menunjukkan hubungan polimorfisme FOXO3 rs2802292 dengan umur panjang manusia dan melindungi individu dari penyakit degeneratif. Munculnya penyakit degeneratif pada lansia dikaitkan dengan penumpukan sel-sel tua yang mengeluarkan sekretom yang disebut senescence-associated secretory phenotype (SASP) yang terdiri dari beberapa sitokin, kemokin, faktor pertumbuhan, protease. Penelitian ini bertujuan untuk menganalisis polimorfisme alel G-alel FOXO3 rs2802292 dan pengaruhnya terhadap SASP dengan mengukur IL-1α, IL-6, IL-8, IL-10, CCL2, dan TGF-β populasi lanjut usia di Posbindu Jakarta Selatan. Penelitian ini dilakukan pada 92 subjek lansia yang tinggal di Jakarta. DNA diisolasi dari darah lengkap kemudian dilanjutkan dengan PCR dan sekuensing untuk analisis FOXO3 rs2802292. SASP dianalisis dari plasma menggunakan Luminex dan ELISA. Hasil penelitian menunjukkan bahwa FOXO3 rs2802292 terdeteksi pada populasi lansia Indonesia dengan frekuensi genotipe GG, GT, TT masing-masing sebesar 0,174, 0,424 dan 0,402. Sedangkan frekuensi alel G dan T masing-masing sebesar 0,385 dan 0,615. Subjek dengan alel G berasosiasi dengan umur panjang. Terdapat perbedaan konsentrasi CCL2 yang signifikan antara kedua kelompok genotipe dengan alel FOXO3 rs2802292 dengan p < 0,05. Sedangkan untuk parameter SASP lainnya tidak terdapat perbedaan bermakna baik antar genotipe GG, GT, TT.
Kata Kunci : FOXO3, rs2802292, SASP, penuaan, inflamasi


Forkhead box O3 (FOXO3) is a transcription factor that regulates stress resistance, metabolism, cell cycle, and apoptosis. Several studies exhibited the association of the FOXO3 polymorphism rs2802292 with human longevity and protects individuals from degenerative diseases. The emergence of degenerative diseases in the elderly is associated with the accumulation of senescent cells that secrete a secretome known as a senescence-associated secretory phenotype (SASP) consists of several cytokines, chemokines, growth factors, proteases. The aim of this research was to analysis polymorphism of FOXO3 gene rs2802292 G-allele and its impact to the SASP by measuring IL-1α, IL-6, IL-8, IL-10, CCL2, and TGF-β in Jakarta elderly populations. This study was conducted on 92 elderly subjects living at Jakarta. DNA was isolated from the whole blood then continued with PCR and sequencing for FOXO3 rs2802292 analysis. SASP was analyzed from the plasma using Luminex and ELISA. The results showed that FOXO3 rs2802292 was detected in Indonesian elderly population as follows GG, GT, TT genotype frequencies were 0,174, 0,424 and 0,402 respectively. Meanwhile, G and T allele frequencies are 0.385 and 0.615 respectively. GG genotype was significantly found in subjects with longevity. There is a significant difference in CCL2 concentration between both genotype groups and the FOXO3 rs2802292 allele with p < 0.05. Although for other SASP parameters there were no significant differences both among GG, GT, TT genotypes.
Keyword : FOXO3, rs2802292, SASP, aging, inflammation