Tesis

Korelasi Cycle Threshold RT PCR SARS-CoV-2 dengan Berbagai Parameter Subset Limfosit pada Pasien COVID-19 di Rumah Sakit Umum Pusat Nasional Dr. Cipto Mangunkusumo = A Correlation between RT PCR SARS-CoV-2 Ct Value and Lymphocyte Subsets in COVID-19 Patients at Dr. Cipto Mangunkusumo Hospital.

COVID-19 merupakan pneumonia yang disebabkan oleh SARS-CoV-2. Metode baku emas untuk mendeteksi SARS-CoV-2 telah ditetapkan oleh World Health Organization (WHO) adalah real time reverse transcriptase. Penelitian menunjukkan nilai Ct memiliki korelasi dengan viral load virus dan terdapat peningkatan risiko kematian pasien COVID-19 pada kelompok Ct < 25,00. Infeksi virus SARS-CoV-2 yang berat berkorelasi dengan nilai Ct yang rendah dan berdampak pada subset limfosit. Penelitian ini bertujuan untuk mencari korelasi antara nilai Ct dengan parameter subset limfosit pada pasien yang terkonfirmasi SARS-CoV- 2. Desain penelitian potong lintang dilakukan pada 96 subjek terkonfirmasi COVID-19. Hasil penelitian tidak didapatkan korelasi yang bermakna antara nilai Ct dengan masingmasing parameter subset limfosit (sel T CD4+, sel T CD8+, sel B, sel NK, dan rasio CD4+/CD8+), tetapi pada analisis subsampel kelompok derajat penyakit sedang sampai kritis didapatkan korelasi terbalik antara sel NK dengan nilai Ct (R = -0,505 dan nilai p = 0,017). Terdapat perbedaan bermakna nilai absolut sel T CD4+ dan sel NK pada kelompok Ct > 30 antara kelompok derajat penyakit ringan dan sedang sampai kritis. Terdapat kecenderungan rasio CD4+/CD8+ lebih rendah bermakna pada pasien dengan derajat penyakit sedang sampai kritis pada kelompok Ct < 25 dengan nilai p = 0,046. Penelitian ini dapat menjadi dasar penelitian selanjutnya untuk menilai sel NK sebagai prediktor keparahan penyakit pasien COVID-19.
Kata Kunci: COVID-19, nilai Ct, subset limfosit, sel NK, sel T CD4+, rasio CD4+/CD8+


COVID-19 is a pneumonia caused by SARS-CoV-2. World Health Organization (WHO) had considered real time reverse transcriptase as a gold standard assay to detect SARS-CoV- 2. Preexisting studies revealed that Ct value was correlated with viral load and there was an increasing risk of mortality among COVID-19 patients having Ct value of < 25,00. A severe SARS-CoV-2 infection correlated with a low Ct value and had an impact on lymphocyte subsets. This study aimed to investigate a correlation between Ct value and lymphocyte subsets in COVID-19 patients. This cross-sectional involved 96 COVID-19 subjects. There were no correlations between Ct value and each lymphocyte subsets parameters (CD4+ T cell, CD8+ T cell, B cell, NK cell, and CD4+/CD8+ ratio), however there were inverse correlations between NK cell and Ct value in the subsample analysis of moderately to critically ill patients (R = -0,505 and p value = 0,017). Absolute CD4+ T cell and NK cell significantly different in mildly and moderately to critically ill patients with Ct > 30. A lower CD4+/CD8+ ratio had a lower tendency to be significant in moderately to critically patients with Ct < 25 (p value = 0,046). This study may serve as a guide for future research to investigate NK cell as a predictor of severity in COVID-19.
Keyword: COVID-19, Ct value, lymphocyte subsets, NK cell, lymphocyte T CD4+ cell, CD4+/CD8+ ratio